Den första sekvensen för ett helt träds genom har nu presenterats, nämligen för jättepoppel (Populus trichocarpa, se bilden).

Trädet visade sig ha ungefär 45 000 proteinbeskrivande gener och forskarna kunde konstatera att trädet relativt nyligen fått hela sitt genom duplicerat. För de flesta par av dubblerade gener som därmed uppstått fick dock det ena exemplaret snabbt en mutation som gjorde att den slogs ut. Hos ungefär 8 000 av de duplicerade generna behölls dock bägge kopiorna. Detta antas bero på att de två kopiorna tidigt fick små skillnader som gjorde att de beskrev något olika proteiner som specialiserade sig på något olika saker.

Forskarna hoppas att kunskapen om detta träds genom ska göra det möjligt att snabba på förädlingen av trädet. Idag tar det nämligen mycket lång tid att utföra förädling på träd, eftersom deras generationstid är lång (ofta flera tiotals år). Det tar därför mycket lång tid att få reda på om en korsning bär den egenskap man hoppats få fram. Forskarna hoppas nu att kunskapen om hela trädets genom ska göra det möjligt att med gentester snabbt plocka ut och arbeta vidare med just de plantor som visat sig ha önskade genvarianter.

Henrik Brändén, oktober 2006
Källa: Science 313, 1596 (2006)
Bild: Jättepoppel, Foto Walter Siegmund under Creative Commons 2.5